12 R Modulo 4.2 - Decomposição da diversidade

RESUMO

Na ecologia de comunidades, a diversidade de espécies é uma medida importante para entender a complexidade e a estrutura de uma comunidade de organismos. Vamos explorar algumas das métricas comuns usadas para avaliar a diversidade de espécies.

Apresentação

Na ecologia de comunidades, a diversidade de espécies é uma medida importante para entender a complexidade e a estrutura de uma comunidade de organismos. Vamos explorar algumas das métricas comuns usadas para avaliar a diversidade de espécies. Essas métricas são usadas para avaliar a diversidade e a estrutura de comunidades ecológicas. Elas podem fornecer informações importantes sobre como as diferentes espécies interagem em um ecossistema e como a diversidade de espécies pode ser afetada por mudanças ambientais ou distúrbios (MAGURRAN, 1988).

12.1 Sobre os dados

Usaremos para esse tutorial dois conjuntos de dados. A Matriz comunitária (ppbio06c-peixes.xlsx) de dados coletados no Programa de Pesquisa em Biodiversidade - PPBio (Veja Programa de Pesquisa em Biodiversidade – PPBio). Esses são dados de espécies de peixes distribuidas em diversas unidades amostrais (UA’s ou sítios). Essa é a matriz bruta de dados, porque os valores ainda não foram ajustados para os valores de Captura Por Unidade de Esforço (CPUE), nem foram relativizados ou transformados.

Além disso usaremos a tabela de agrupamentos (ppbio06-grupos)

Revise as informações sobre as bases de dados no capítulo Bases de Dados. A matriz de dados para esse Módulo pode ser baixada na seção Arquivos disponíveis.

Revise o módulo anterior Estrutura da Comunidade

12.2 Organização básica

Apêndices

Script limpo

Aqui apresento o scrip na íntegra sem os textos ou outros comentários. Você pode copiar e colar no R para executa-lo. Lembre de remover os # ou ## caso necessite executar essas linhas.

Referências

Bibliografia Geral

MAGURRAN, A. E. Ecological Diversity and Its Measurement. [s.l.] : Croom Helm Ltd, 1988. p. 179